崇西中學前身為1950年春成立的私立崇西中學，學校設在廟鎮西市。1952年暑假改名為崇明縣崇西中學，校址遷至現在崇西中學所在地。

　　1952年10月，將崇明縣崇西中學改為蘇北崇西中學。1953年學校由蘇北崇西中學改為崇明縣崇西中學。1954年暑假，學校高中部并入崇明中學，崇西中學成為初級中學。

　　1958年崇明劃歸上海市，9月根據縣教育局意見崇西初級中學恢復完中。

　　十一屆三中全會后，校容校貌煥然一新。2008年學校停招高中新生，崇西中學成為一所初級中學。